Distributed Tree Kernels

In this paper, we propose the distributed tree kernels (DTK) as a novel method to reduce time and space complexity of tree kernels. Using a linear complexity algorithm to compute vectors for trees, we embed feature spaces of tree fragments in low-dimensional spaces where the kernel computation is directly done with dot product. We show that DTKs are faster, correlate with tree kernels, and obtain a statistically similar performance in two natural language processing tasks.Comment: ICML201

Delivery of fluorophores by calcium phosphate-coated nanoliposomes and interaction with Staphylococcus aureus biofilms

The delivery capacity and mechanical stability of calcium phosphate (CaP) coated 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphate (DOPA) liposomes free and adsorbed on bacterial surface was investigated introducing either acridine orange (AO) or 5,10,15,20-Tetrakis(1-methyl-4-pyridinio)porphyrin (TMP) in the aqueous core of the liposomes. The obtained nanomaterials were thoroughly characterized by electron and optical microscopy and by fluorescence techniques. Distribution of the AO and TMP molecules between the aqueous liposomes core and the outer solution was demonstrated by the band shifts and broadening of the excitation–emission matrices and the modified Stern-Volmer model for fluorescence quenching. In aqueous suspensions, c.a. 40% of AO was released to the outer solution while only a small percentage of TMP was observed to reach the outer liposome surface. The nanoliposomes adhesion capacity and the leaking of fluorophore molecules to Staphylococcus aureus (S. aureus) biofilms were further evaluated. A close interaction between liposomes and S. aureus biofilm was evidenced by TEM and SEM imaging. Epifluorescence experiments demonstrated that CaP-coated liposomes have good biofilm staining capability after two hours incubation of the biofilms with the liposomes, thus supporting an important release of the fluorophores when in contact with the biofilm. Altogether, the obtained results strongly suggest that CaP-coated liposomes are capable of activating drug release when in presence of S. aureus biofilms and smears. The studies herein presented, indicate that CaP-coated liposomes are potential vehicles for the selective delivery of drugs to S. aureus biofilms, as is the case of the singlet oxygen photosensitizer TMP, a well known photodynamic antibacterial agent.Fil: Rivero Berti, Ignacio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; ArgentinaFil: Dell'arciprete, Maria Laura. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; ArgentinaFil: Dittler, Maria Laura. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; ArgentinaFil: Miñan, Alejandro Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; ArgentinaFil: Fernandez Lorenzo, Monica Alicia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; ArgentinaFil: Gonzalez, Monica Cristina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; Argentin

Polyethylene glycol-coated blue-emitting silicon dots with improved properties for uses in aqueous and biological environments

Grafting of polyethylene glycol (PEG) to ultrasmall photoluminescent silicon dots (SiDs) is expected to improve and expand the applications of these particles to aqueous environments and biological systems. Herein we report a novel one-pot synthesis of robust, highly water compatible PEG-coated SiDs (denoted as PEG-SiDs) of (3.3 ± 0.5) nm size. The nanoparticles' synthesis is based on the liquid phase oxidation of magnesium silicide using PEG as reaction media and leading to high PEG density grafting. PEG-SiDs enhanced photophysical, photosensitising, and solution properties in aqueous environments are described and compared to those of 2 nm size PEG-coated SiDs with low PEG density grafting (denoted as PEG-NHSiDs) obtained from a multistep synthesis strategy. PEG-SiDs form highly dispersed suspensions in water showing stable photoluminescence and quantum yields of Φ = 0.13 ± 0.04 at 370 nm excitation in air-saturated suspensions. These particles exhibited the capacity of photosensitising the formation of singlet molecular oxygen, not observed for PEG-NHSiDs. PEG robust shielding of the silicon core luminescent properties is further demonstrated in bio-imaging experiments stressing the strong interaction between PEG-SiDs and Staphylococcus aureus smears by observing the photoluminescence of particles. PEG-SiDs were found to be nontoxic to S. aureus cells at concentrations of 100 mg ml-1, though a bacteriostatic effect on S. aureus biofilms was observed upon UV-A irradiation under conditions where light alone has no effect.Fil: Rodríguez Sartori, Damián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; ArgentinaFil: Lillo, Rolando Cristian Rodrigo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; ArgentinaFil: Romero, Juan José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; ArgentinaFil: Dell'arciprete, Maria Laura. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; ArgentinaFil: Miñan, Alejandro Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; ArgentinaFil: Fernandez Lorenzo, Monica Alicia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ingeniería; ArgentinaFil: Gonzalez, Monica Cristina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; Argentin